马耳他税收收入主要来源于间接税收、直接税收和社会保险贡献三个方面。其中，间接税收的主要来源是与产品和进口有关的税收，包括增值税（VAT）、进口税、服务税和金融资本交易税。直接税是对收入和财富征收的税种。社会保险贡献是雇主和雇员（包括自雇人士）强制缴纳的社会保险费用。马耳他主要税种包括所得税（个人所得税的限额为35%）、增值税、印花税、关税和消费税。

马耳他的居民或居住在马耳他的人士均有纳税义务，如为马耳他居民但并未在马耳他居住，则只需对在马耳他境内发生或者获得的收入和资本收益缴纳所得税，非马耳他居民也需对在马耳他获得的收入和资本收益缴纳所得税。《所得税法》规定，凡买卖有价证券、房产、商标、无形资产等产生资本收益的活动，应征收所得税。在资产转移时需征收资产价值12%的所得税。在马耳他经营的公司或企业，纳税时也被视为是在马耳他居住的个人，同样需交纳所得税，需对在马耳他境内发生或者获得的收入和资本收益纳税。

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